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유용한 VCF manipulation commands

시퀀싱 결과 최종 파일은 변이들에 대한 정보를 담고 있는 VCF 파일입니다. 여러 가지 조건에 맞게 변이들을 Filtering하고, 입맛에 맞게 관련 정보들을 Annotation하는 것은 후속 단계에서 의미 있는 변이들만 남기는데 있어서 거의 필수적이라고 할 수 있습니다. 이번 포스팅은 VCF 파일을 조작하는데 있어 유용한 bcftools의 명령어들을 정리하려고 합니다. [관련 포스팅 보기] NGS DNA-SEQ PIPELINE: GATK BEST PRACTICE CODE – PART3. VCF MANIPULATION [계속

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